Мустақиллик йилларида институтда ўқув-услубий ишлар тубдан ўзгарди. Биринчи навбатда шахсан Президентимиз И.А.Каримов ташаббуслари билан 1997 йил 29 августда “Кадрлар тайёрлаш миллий дастури” ҳамда “Таълим тўғрисида” Қонунлар қабул қилинди. Бунда узлуксиз таълим тизими, хусусан олий таълимнинг бакалавриат ва магистратура босқичлари ҳамда дипломдан сўнг узлуксиз малака ошириш жорий этилганлигини алоҳида таъкидлаш лозим.“Кадрлар тайёрлаш миллий дастури” жаҳон олимлари томонидан тан олинди ва бу дастур бир қанча ўн йилларга таълим тизими соҳасида асосий дастур бўлиб қолмоқда.