Пищеварительный тракт представляет собой одну из наиболее сложных эко–систем, включающую в себя несколько различных по биологическим характеристикам мест обитания микроорганизмов (биотопов). Состав нормальной микрофлоры каждого биотопа (полость рта, пищевод, желудок, двенадцатиперстная, тонкая и толстая кишки) различен и специфичен. Кроме того, микробная флора желудочно–кишечного тракта (ЖКТ) находится в постоянном динамическом равновесии с разнообразными факторами внешней среды, собственного организма и естественной резистентности. Это равновесие обусловлено очень тонко сбалансированным взаимодействием между клетками пищеварительной системы, микробной флорой и иммунной системой. У детей эти взаимодействия носят лабильный характер и зависят от: анатомо–физиологических особенностей ЖКТ; возраста, характера питания и образа жизни ребенка. Качественное и/или количественное изменение состава микрофлоры пищеварительного тракта у детей в различные периоды детства имеют свои особенности.